Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trappc6aQ78XR0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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