Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rph3alQ768S4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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