Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nme8Q715T0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms