Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms