Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc44a1Q6X893 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms