Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Timd4Q6U7R4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Timd4Q6U7R4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Timd4Q6U7R4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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