Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.6 ms