Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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