Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms