Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms