Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms