Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Senp6Q6P7W0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Senp6Q6P7W0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms