Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y5

Znf280c, Zinc finger protein 280C, mousemouse

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Length 742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280cQ6P3Y5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf280cQ6P3Y5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf280cQ6P3Y5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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