Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms