Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms