Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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