Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atg9bQ6EBV9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms