Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cep290Q6A078 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cep290Q6A078 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms