Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrcc1Q69ZB0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms