Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Tbr1Q64336 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Tbr1Q64336 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tbr1Q64336 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tbr1Q64336 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tbr1Q64336 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tbr1Q64336 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tbr1Q64336 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tbr1Q64336 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tbr1Q64336 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tbr1Q64336 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbr1Q64336 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tbr1Q64336 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tbr1Q64336 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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