Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms