Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20809Q62458 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms