Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms