Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema5aQ62217 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms