Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms