Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Odf1Q61999 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Odf1Q61999 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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