Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd47Q61735 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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