Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcd1Q61466 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms