Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd6Q61003 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd6Q61003 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd6Q61003 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd6Q61003 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms