Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp7Q60973 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms