Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms