Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Caprin1Q60865 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Caprin1Q60865 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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