Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms