Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms