Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms