Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms