Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Frem3Q5H8B9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms