Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms