Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms