Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Nlrc3Q5DU56 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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