Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms