Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf608Q56A10 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf608Q56A10 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms