Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms