Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc43Q3V0L5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms