Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3V0E1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3V0E1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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