Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp48Q3V0C5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp48Q3V0C5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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