Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ttc9Q3V038 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ttc9Q3V038 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ttc9Q3V038 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ttc9Q3V038 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms