Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed1Q3V009 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms