Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms