Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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